การรักษาภาวะสายตาผิดปกติด้วยวิธี femtosecond LASIK ประกอบด้วย 2 ขั้นตอนหลัก คือ

• ขั้นตอนแรก แพทย์จะแยกชั้นกระจกตาด้วยแสงเลเซอร์โดยใช้ femtosecond laser ให้ได้ฝากระจกตาชั้นนอกลักษณะคล้ายบานพับ เพื่อที่จะเปิดออกไปด้านข้างให้เห็นเนื้อกระจกตาด้านล่างสำหรับรองรับการยิงเอ็กไซเมอร์เลเซอร์ (excimer laser) ซึ่งเป็นเลเซอร์เย็นที่มีความแม่นยำสูงในขั้นตอนต่อไป
• ขั้นตอนที่สอง แพทย์จะเปิดฝากระจกตา แล้วใช้เอ็กไซเมอร์เลเซอร์ยิงลงไปบนเนื้อกระจกตาด้านล่างเพื่อปรับความโค้งของกระจกตา เป็นการแก้ไขค่าสายตาที่ผิดปกติ จากนั้นจึงปิดฝากระจกตากลับเข้าที่ตามเดิมโดยไม่มีการเย็บ

• มีสายตาสั้น สายตาเอียง หรือสายตายาวแต่กำเนิด
• มีอายุ 20 ปีขึ้นไป และมีสายตาคงที่อย่างน้อย 1 ปี (ค่าสายตาเปลี่ยนแปลงไม่เกิน 0.5 diopter ใน 1 ปี)
• ไม่มีโรคของกระจกตาหรือโรคตาที่รุนแรง เช่น จอประสาทตาเสื่อม ตาแห้งอย่างรุนแรง หรือโรคทางร่างกายที่มีผลต่อการหายของแผล เช่น โรคเบาหวานที่ควบคุมไม่ได้ โรคเอสแอลอี เป็นต้น
• มีปัญหาในการสวมแว่นหรือคอนแทคเลนส์ซึ่งกระทบต่ออาชีพ กิจวัตรประจำวัน หรืองานอดิเรก
• ไม่อยู่ในระหว่างตั้งครรภ์หรือให้นมบุตร
• มีความเสี่ยงต่อการแยกชั้นกระจกตาด้วยใบมีด เช่น ขนาดลูกตาเล็ก เนื่องจาก femtosecond laser ถูกออกแบบให้ใช้พื้นที่บนดวงตาน้อยกว่าการใช้ใบมีด หรือมีกระจกตาโก่งหรือแบนกว่าปกติ เพราะการทำงานของ femtosecond laser ไม่ขึ้นกับความโค้งของกระจกตา
• มีความรู้สึกกลัวการผ่าตัดแบบเดิม ซึ่งขณะแยกชั้นกระจกตาจะมีเสียงดังจากมอเตอร์และมองไม่เห็นแสงไฟราว 20 วินาที ขณะที่ femtosecond laser ไม่มีเสียง ให้ความรู้สึกนุ่มนวล แรงที่สัมผัสตาจะน้อยกว่า จึงมีความรู้สึกสบายตากว่า

ก่อนเข้ารับการรักษาภาวะสายตาผิดปกติด้วย femtosecond LASIK จะต้องมีการตรวจประเมินสภาพสายตา โดยใช้เวลาประมาณ 3 ชั่วโมง ดังนี้

• ตรวจวัดค่าสายตาด้วยเครื่องคอมพิวเตอร์ 
• ทดสอบการมองเห็น
• วัดความดันตา
• ตรวจและวัดค่าสายตาโดยจักษุแพทย์
• วัดปริมาณน้ำตา
• ตรวจหาค่าการกระจายตัวของแสงในลูกตา (wavefront aberration) ด้วยเครื่อง wavefront analyser
• ถ่ายภาพพื้นผิวกระจกตาและวัดความหนาของกระจกตา
• หยอดยาขยายม่านตา
• ตรวจสภาพจอประสาทตาอย่างละเอียดโดยจักษุแพทย์

การใช้ femtosecond laser เป็นการเพิ่มความปลอดภัยในการแยกชั้นกระจกตาและเพิ่มคุณภาพของการมองเห็นหลังทำเลสิกเทียบกับการใช้ใบมีด เนื่องจากเลเซอร์มีความแม่นยำสูงมาก สามารถกำหนดลักษณะของฝากระจกตาที่ต้องการได้

• ช่วยลดความคลาดเคลื่อนของการแยกชั้นกระจกตา กระจกตาที่แยกได้มีความเรียบ มีความหนาเท่ากันหมดทั้งแผ่น ลดปัญหาฝากระจกตาไม่สมบูรณ์ต่างๆ และผิวกระจกตาถลอก
• ขอบฝากระจกตาตัดเรียบเป็นมุมเข้ากับเนื้อกระจกตาด้านล่างได้พอดี ฝากระจกตาจึงปิดกลับลงที่เดิมได้สนิท ลดโอกาสเกิดฝากระจกตาย่นหรือไม่กลับเข้าที่เดิม และช่วยลดปัญหาภาวะแสงกระจายตอนกลางคืน
• ช่วยให้กระจกตาสมานตัวเร็ว ระยะพักฟื้นลดลง
• ลดอาการตาแห้งของผู้ป่วยภายหลังผ่าตัด
• ใช้เวลาในการผ่าตัดโดยรวมเฉลี่ยข้างละ 15 นาที

• หลีกเลี่ยงการบีบตาหรือขยี้ตาแรงๆ ในช่วง 2 สัปดาห์แรก เนื่องจากฝากระจกตาที่แยกชั้นด้วย femtosecond laser จะมีความบางมาก
• ควรใส่ที่ครอบตาเวลานอนเป็นเวลา 1 สัปดาห์ เพื่อป้องกันการขยี้ตาโดยไม่รู้ตัว
• ระวังไม่ให้น้ำเข้าตาเป็นเวลา 1 สัปดาห์
• หยอดตาให้ครบตามที่แพทย์สั่ง
• ไม่ควรใช้สายตาในการจ้องมองมากเกินไป โดยเฉพาะอย่างยิ่งการอ่านหนังสือหรือใช้คอมพิวเตอร์
• ตรวจติดตามการรักษาอย่างต่อเนื่องตลอดระยะเวลา 6 เดือนถึง 1 ปี