การตรวจคัดกรองทำได้หลายวิธี เช่น การตรวจหาเลือดในอุจจาระ การตรวจเอกซเรย์คอมพิวเตอร์ แต่วิธีการตรวจที่ดีที่สุดคือการส่องกล้องตรวจลำไส้ใหญ่ (colonoscope) เพราะแพทย์สามารถมองเห็นรายละเอียดและประเมินอาการผิดปกติต่างๆภายในลำไส้ใหญ่ได้อย่างแม่นยำ

วิธีการคัดกรองตรวจหามะเร็งลำไส้ใหญ่มี 3 วิธี

1. การเก็บอุจจาระ เพื่อตรวจหาเลือดในอุจจาระหรือหา DNA 
2. การส่องกล้องตรวจลำไส้ใหญ่ คือการเอากล้อง Colonoscopy ส่องเข้าไปในทางทวารหนัก เป็นวิธีการที่ดีที่สุดซึ่งสามารถจะมองเห็นโดยตรง และสามารถเอาชิ้นเนื้อออกมาตรวจได้ เพื่อพิสูจน์ว่าติ่งเนื้อที่เกิดขึ้นนั้นเป็นมะเร็งหรือไม่เป็นมะเร็ง
3. เอกซเรย์คอมพิวเตอร์ เรียกว่า CT Colonoscopy  แผนกเอกซเรย์ก็เอาอุปกรณ์ใส่ไปในทวาร และก็ใส่สารทึบรังสีเข้าไปในทวาร เพื่อเห็นภาพออกมาในรูปแบบเงา

ดังนั้นการส่องกล้องตรวจลำไส้ใหญ่เป็นวิธีมาตรฐานที่ดีที่สุดในปัจจุบัน ที่จะตรวจกรองหามะเร็งลำไส้ใหญ่ แพทย์สามารถเห็นความผิดปกติด้วยสายตาโดยตรง และสามารถตัดชิ้นเนื้อไปตรวจได้ในคราวเดียว